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• Cancillería. Registro del Sello de Corte
  Archivo General de Simancas
• Angola
  Arquivo Histórico Ultramarino
• Consejo de Inquisición
  Archivo Histórico Nacional
• Mexico - Copied Material
  הארכיון המרכזי לתולדות העם היהודי (Central Archives for the History of the Jewish People)
• Rio de Janeiro
  Arquivo Histórico Ultramarino
• Tribunal de la Inquisición de Toledo
  Archivo Histórico Nacional
• Fonds de la commune de Bayonne, archives antérieures à 1790
  Archives départementales des Pyrénées-Atlantiques (Pôle de Bayonne et du Pays basque)
• Dupuy (Fonds)
  Bibliothèque Nationale de France (Richelieu)
• Additional Manuscripts: Western Manuscripts
  British Library
• Egerton Manuscripts
  British Library
• Mexican Inquisition Original Documents
  The Bancroft Library, University of California, Berkeley
• Spain collection
  Yale University Library
• Inquisição de Lamego
  Arquivo Nacional da Torre do Tombo
• Inquisição do Porto
  Arquivo Nacional da Torre do Tombo
• Inquisição de Coimbra
  Arquivo Nacional da Torre do Tombo
• Haus-, Hof- und Staatsarchiv
  Österreichisches Staatsarchiv
• Inquisição de Évora
  Arquivo Nacional da Torre do Tombo
• Manoscritti
  Biblioteca Casanatense
• Fondo Borghese
  Archivio Apostolico Vaticano
• Armário Jesuítico e Cartório dos Jesuítas
  Arquivo Nacional da Torre do Tombo
• Manuscritos da Livraria
  Arquivo Nacional da Torre do Tombo
• Códices
  Biblioteca da Ajuda
• Colecção de Manuscritos
  Arquivo Distrital de Braga
• Manuscritos Avulsos
  Biblioteca Nacional de Portugal
• Manuscritos
  Biblioteca Pública Municipal do Porto